Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMCO5AQ8N6Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMCO5AQ8N6Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO5AQ8N6Q1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO5AQ8N6Q1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO5AQ8N6Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO5AQ8N6Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO5AQ8N6Q1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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