Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PDCL2Q8N4E4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDCL2Q8N4E4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL2Q8N4E4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PDCL2Q8N4E4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDCL2Q8N4E4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDCL2Q8N4E4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PDCL2Q8N4E4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PDCL2Q8N4E4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDCL2Q8N4E4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PDCL2Q8N4E4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PDCL2Q8N4E4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL2Q8N4E4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PDCL2Q8N4E4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PDCL2Q8N4E4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PDCL2Q8N4E4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PDCL2Q8N4E4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PDCL2Q8N4E4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PDCL2Q8N4E4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDCL2Q8N4E4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDCL2Q8N4E4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDCL2Q8N4E4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDCL2Q8N4E4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms