Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBARPQ8N350 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBARPQ8N350 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBARPQ8N350 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CBARPQ8N350 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CBARPQ8N350 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CBARPQ8N350 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CBARPQ8N350 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CBARPQ8N350 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CBARPQ8N350 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CBARPQ8N350 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBARPQ8N350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBARPQ8N350 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CBARPQ8N350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CBARPQ8N350 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CBARPQ8N350 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CBARPQ8N350 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CBARPQ8N350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CBARPQ8N350 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CBARPQ8N350 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CBARPQ8N350 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms