Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD3Q8N144 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD3Q8N144 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD3Q8N144 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD3Q8N144 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD3Q8N144 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJD3Q8N144 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD3Q8N144 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD3Q8N144 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD3Q8N144 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJD3Q8N144 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJD3Q8N144 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GJD3Q8N144 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD3Q8N144 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD3Q8N144 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD3Q8N144 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD3Q8N144 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GJD3Q8N144 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GJD3Q8N144 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GJD3Q8N144 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GJD3Q8N144 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJD3Q8N144 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GJD3Q8N144 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GJD3Q8N144 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GJD3Q8N144 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD3Q8N144 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJD3Q8N144 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJD3Q8N144 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms