Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGI4Q8N135 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGI4Q8N135 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGI4Q8N135 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGI4Q8N135 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGI4Q8N135 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGI4Q8N135 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LGI4Q8N135 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGI4Q8N135 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGI4Q8N135 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGI4Q8N135 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LGI4Q8N135 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGI4Q8N135 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LGI4Q8N135 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGI4Q8N135 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms