Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC71Q8IV32 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC71Q8IV32 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC71Q8IV32 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC71Q8IV32 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC71Q8IV32 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC71Q8IV32 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC71Q8IV32 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC71Q8IV32 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC71Q8IV32 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC71Q8IV32 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC71Q8IV32 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC71Q8IV32 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC71Q8IV32 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC71Q8IV32 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms