Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDLRAD3Q86YD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD3Q86YD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRAD3Q86YD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRAD3Q86YD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRAD3Q86YD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LDLRAD3Q86YD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDLRAD3Q86YD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDLRAD3Q86YD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LDLRAD3Q86YD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms