Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PALB2Q86YC2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALB2Q86YC2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PALB2Q86YC2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PALB2Q86YC2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PALB2Q86YC2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALB2Q86YC2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALB2Q86YC2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PALB2Q86YC2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALB2Q86YC2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALB2Q86YC2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALB2Q86YC2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PALB2Q86YC2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PALB2Q86YC2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALB2Q86YC2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PALB2Q86YC2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALB2Q86YC2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALB2Q86YC2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PALB2Q86YC2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PALB2Q86YC2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PALB2Q86YC2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PALB2Q86YC2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PALB2Q86YC2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PALB2Q86YC2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PALB2Q86YC2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms