Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM73Q86UV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM73Q86UV7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM73Q86UV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM73Q86UV7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM73Q86UV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM73Q86UV7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM73Q86UV7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM73Q86UV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM73Q86UV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM73Q86UV7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM73Q86UV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM73Q86UV7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms