Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SETD3Q86TU7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SETD3Q86TU7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SETD3Q86TU7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SETD3Q86TU7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SETD3Q86TU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SETD3Q86TU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SETD3Q86TU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SETD3Q86TU7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD3Q86TU7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SETD3Q86TU7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD3Q86TU7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETD3Q86TU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD3Q86TU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETD3Q86TU7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETD3Q86TU7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD3Q86TU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms