Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z769

SLC35E3, Solute carrier family 35 member E3, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E3Q7Z769 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC35E3Q7Z769 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35E3Q7Z769 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC35E3Q7Z769 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC35E3Q7Z769 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC35E3Q7Z769 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35E3Q7Z769 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E3Q7Z769 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35E3Q7Z769 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35E3Q7Z769 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35E3Q7Z769 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35E3Q7Z769 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35E3Q7Z769 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35E3Q7Z769 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms