Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LPCAT2Q7L5N7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPCAT2Q7L5N7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LPCAT2Q7L5N7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LPCAT2Q7L5N7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LPCAT2Q7L5N7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LPCAT2Q7L5N7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LPCAT2Q7L5N7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LPCAT2Q7L5N7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LPCAT2Q7L5N7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LPCAT2Q7L5N7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LPCAT2Q7L5N7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LPCAT2Q7L5N7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LPCAT2Q7L5N7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LPCAT2Q7L5N7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LPCAT2Q7L5N7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LPCAT2Q7L5N7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms