Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP34Q70CQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP34Q70CQ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP34Q70CQ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP34Q70CQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP34Q70CQ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP34Q70CQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP34Q70CQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP34Q70CQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP34Q70CQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP34Q70CQ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP34Q70CQ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP34Q70CQ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP34Q70CQ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
USP34Q70CQ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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