Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DEF8Q6ZN54 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DEF8Q6ZN54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEF8Q6ZN54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEF8Q6ZN54 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEF8Q6ZN54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEF8Q6ZN54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEF8Q6ZN54 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEF8Q6ZN54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEF8Q6ZN54 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEF8Q6ZN54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEF8Q6ZN54 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEF8Q6ZN54 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms