Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN54

DEF8, Differentially expressed in FDCP 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF8Q6ZN54 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DEF8Q6ZN54 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DEF8Q6ZN54 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DEF8Q6ZN54 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DEF8Q6ZN54 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
DEF8Q6ZN54 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DEF8Q6ZN54 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DEF8Q6ZN54 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DEF8Q6ZN54 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DEF8Q6ZN54 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DEF8Q6ZN54 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DEF8Q6ZN54 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DEF8Q6ZN54 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DEF8Q6ZN54 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DEF8Q6ZN54 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DEF8Q6ZN54 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DEF8Q6ZN54 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEF8Q6ZN54 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DEF8Q6ZN54 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
DEF8Q6ZN54 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DEF8Q6ZN54 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DEF8Q6ZN54 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEF8Q6ZN54 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DEF8Q6ZN54 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DEF8Q6ZN54 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DEF8Q6ZN54 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEF8Q6ZN54 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEF8Q6ZN54 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DEF8Q6ZN54 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DEF8Q6ZN54 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DEF8Q6ZN54 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DEF8Q6ZN54 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DEF8Q6ZN54 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DEF8Q6ZN54 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DEF8Q6ZN54 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DEF8Q6ZN54 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DEF8Q6ZN54 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DEF8Q6ZN54 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DEF8Q6ZN54 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DEF8Q6ZN54 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DEF8Q6ZN54 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEF8Q6ZN54 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DEF8Q6ZN54 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DEF8Q6ZN54 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DEF8Q6ZN54 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DEF8Q6ZN54 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DEF8Q6ZN54 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DEF8Q6ZN54 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DEF8Q6ZN54 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DEF8Q6ZN54 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DEF8Q6ZN54 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DEF8Q6ZN54 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DEF8Q6ZN54 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DEF8Q6ZN54 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DEF8Q6ZN54 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DEF8Q6ZN54 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DEF8Q6ZN54 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DEF8Q6ZN54 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DEF8Q6ZN54 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEF8Q6ZN54 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DEF8Q6ZN54 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEF8Q6ZN54 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEF8Q6ZN54 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DEF8Q6ZN54 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEF8Q6ZN54 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DEF8Q6ZN54 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DEF8Q6ZN54 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEF8Q6ZN54 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEF8Q6ZN54 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEF8Q6ZN54 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEF8Q6ZN54 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEF8Q6ZN54 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEF8Q6ZN54 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEF8Q6ZN54 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DEF8Q6ZN54 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DEF8Q6ZN54 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DEF8Q6ZN54 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DEF8Q6ZN54 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DEF8Q6ZN54 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DEF8Q6ZN54 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DEF8Q6ZN54 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DEF8Q6ZN54 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DEF8Q6ZN54 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms