Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWW0

LCN15, Lipocalin-15, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN15Q6UWW0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN15Q6UWW0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCN15Q6UWW0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LCN15Q6UWW0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN15Q6UWW0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LCN15Q6UWW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN15Q6UWW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LCN15Q6UWW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN15Q6UWW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN15Q6UWW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN15Q6UWW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCN15Q6UWW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms