Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SUSD1Q6UWL2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD1Q6UWL2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SUSD1Q6UWL2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SUSD1Q6UWL2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SUSD1Q6UWL2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SUSD1Q6UWL2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SUSD1Q6UWL2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SUSD1Q6UWL2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD1Q6UWL2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD1Q6UWL2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD1Q6UWL2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD1Q6UWL2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUSD1Q6UWL2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUSD1Q6UWL2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms