Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SAMD1Q6SPF0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SAMD1Q6SPF0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
SAMD1Q6SPF0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SAMD1Q6SPF0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SAMD1Q6SPF0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SAMD1Q6SPF0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SAMD1Q6SPF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SAMD1Q6SPF0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SAMD1Q6SPF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SAMD1Q6SPF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SAMD1Q6SPF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SAMD1Q6SPF0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SAMD1Q6SPF0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SAMD1Q6SPF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SAMD1Q6SPF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SAMD1Q6SPF0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SAMD1Q6SPF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SAMD1Q6SPF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SAMD1Q6SPF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SAMD1Q6SPF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SAMD1Q6SPF0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SAMD1Q6SPF0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SAMD1Q6SPF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SAMD1Q6SPF0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SAMD1Q6SPF0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms