Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.85e-11■■■■■ 97.2
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PRPF8Q6P2Q9 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.693e-24■■■■■ 89.8
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PRPF8Q6P2Q9 GOLGA1-203ENST00000421514 589 ntTSL 26.93□□□□□ -1.32e-14■■■■■ 89.5
PRPF8Q6P2Q9 EARS2-216ENST00000565344 550 ntTSL 39.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 89.4
PRPF8Q6P2Q9 EARS2-203ENST00000562402 580 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 89.4
PRPF8Q6P2Q9 TIAL1-208ENST00000470635 336 ntTSL 38.07□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 88.9
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PRPF8Q6P2Q9 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.582e-13■■■■■ 88.7
PRPF8Q6P2Q9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-13■■■■■ 88.7
PRPF8Q6P2Q9 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 88.7
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-8■■■■■ 88.5
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PRPF8Q6P2Q9 COPS7A-202ENST00000455113 1718 ntTSL 314.99□□□□□ -0.016e-24■■■■■ 88.5
PRPF8Q6P2Q9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.116e-24■■■■■ 88.5
PRPF8Q6P2Q9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.146e-24■■■■■ 88.5
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