Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CARMIL2Q6F5E8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
CARMIL2Q6F5E8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CARMIL2Q6F5E8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CARMIL2Q6F5E8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CARMIL2Q6F5E8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CARMIL2Q6F5E8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.46■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CARMIL2Q6F5E8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
CARMIL2Q6F5E8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CARMIL2Q6F5E8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
CARMIL2Q6F5E8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CARMIL2Q6F5E8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CARMIL2Q6F5E8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CARMIL2Q6F5E8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CARMIL2Q6F5E8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CARMIL2Q6F5E8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CARMIL2Q6F5E8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CARMIL2Q6F5E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CARMIL2Q6F5E8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CARMIL2Q6F5E8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CARMIL2Q6F5E8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CARMIL2Q6F5E8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
CARMIL2Q6F5E8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CARMIL2Q6F5E8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
CARMIL2Q6F5E8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
CARMIL2Q6F5E8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CARMIL2Q6F5E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
CARMIL2Q6F5E8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CARMIL2Q6F5E8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CARMIL2Q6F5E8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
CARMIL2Q6F5E8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CARMIL2Q6F5E8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
CARMIL2Q6F5E8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CARMIL2Q6F5E8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CARMIL2Q6F5E8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CARMIL2Q6F5E8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CARMIL2Q6F5E8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CARMIL2Q6F5E8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CARMIL2Q6F5E8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
CARMIL2Q6F5E8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
CARMIL2Q6F5E8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CARMIL2Q6F5E8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
CARMIL2Q6F5E8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
CARMIL2Q6F5E8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
CARMIL2Q6F5E8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44.5■■■■■ 4.71
CARMIL2Q6F5E8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
CARMIL2Q6F5E8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
CARMIL2Q6F5E8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CARMIL2Q6F5E8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms