Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MCTP1Q6DN14 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
MCTP1Q6DN14 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MCTP1Q6DN14 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MCTP1Q6DN14 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MCTP1Q6DN14 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MCTP1Q6DN14 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MCTP1Q6DN14 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MCTP1Q6DN14 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MCTP1Q6DN14 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MCTP1Q6DN14 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MCTP1Q6DN14 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MCTP1Q6DN14 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MCTP1Q6DN14 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MCTP1Q6DN14 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
MCTP1Q6DN14 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MCTP1Q6DN14 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MCTP1Q6DN14 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MCTP1Q6DN14 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
MCTP1Q6DN14 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MCTP1Q6DN14 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCTP1Q6DN14 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms