Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms