Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
YOD1Q5VVQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YOD1Q5VVQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YOD1Q5VVQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YOD1Q5VVQ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YOD1Q5VVQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YOD1Q5VVQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YOD1Q5VVQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YOD1Q5VVQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YOD1Q5VVQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YOD1Q5VVQ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms