Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SOGA3Q5TF21 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SOGA3Q5TF21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SOGA3Q5TF21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SOGA3Q5TF21 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SOGA3Q5TF21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SOGA3Q5TF21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SOGA3Q5TF21 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SOGA3Q5TF21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SOGA3Q5TF21 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SOGA3Q5TF21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SOGA3Q5TF21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SOGA3Q5TF21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SOGA3Q5TF21 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SOGA3Q5TF21 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SOGA3Q5TF21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SOGA3Q5TF21 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SOGA3Q5TF21 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SOGA3Q5TF21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SOGA3Q5TF21 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SOGA3Q5TF21 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SOGA3Q5TF21 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SOGA3Q5TF21 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SOGA3Q5TF21 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SOGA3Q5TF21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SOGA3Q5TF21 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SOGA3Q5TF21 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SOGA3Q5TF21 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SOGA3Q5TF21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SOGA3Q5TF21 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SOGA3Q5TF21 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SOGA3Q5TF21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOGA3Q5TF21 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SOGA3Q5TF21 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SOGA3Q5TF21 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SOGA3Q5TF21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SOGA3Q5TF21 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SOGA3Q5TF21 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SOGA3Q5TF21 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms