Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATPAF1Q5TC12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATPAF1Q5TC12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATPAF1Q5TC12 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATPAF1Q5TC12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATPAF1Q5TC12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATPAF1Q5TC12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATPAF1Q5TC12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATPAF1Q5TC12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATPAF1Q5TC12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms