Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
BEND3Q5T5X7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BEND3Q5T5X7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
BEND3Q5T5X7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BEND3Q5T5X7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BEND3Q5T5X7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BEND3Q5T5X7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BEND3Q5T5X7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BEND3Q5T5X7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
BEND3Q5T5X7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
BEND3Q5T5X7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
BEND3Q5T5X7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
BEND3Q5T5X7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BEND3Q5T5X7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
BEND3Q5T5X7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
BEND3Q5T5X7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
BEND3Q5T5X7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BEND3Q5T5X7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
BEND3Q5T5X7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BEND3Q5T5X7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BEND3Q5T5X7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BEND3Q5T5X7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BEND3Q5T5X7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BEND3Q5T5X7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms