Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOHLH1Q5JUK2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOHLH1Q5JUK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOHLH1Q5JUK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOHLH1Q5JUK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOHLH1Q5JUK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOHLH1Q5JUK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOHLH1Q5JUK2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SOHLH1Q5JUK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOHLH1Q5JUK2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOHLH1Q5JUK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms