Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EMC4Q5J8M3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMC4Q5J8M3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMC4Q5J8M3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EMC4Q5J8M3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EMC4Q5J8M3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EMC4Q5J8M3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMC4Q5J8M3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EMC4Q5J8M3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMC4Q5J8M3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMC4Q5J8M3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms