Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFAIP8L3Q5GJ75 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNFAIP8L3Q5GJ75 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP8L3Q5GJ75 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP8L3Q5GJ75 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNFAIP8L3Q5GJ75 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNFAIP8L3Q5GJ75 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNFAIP8L3Q5GJ75 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFAIP8L3Q5GJ75 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms