Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC178Q5BJE1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC178Q5BJE1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC178Q5BJE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC178Q5BJE1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC178Q5BJE1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC178Q5BJE1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC178Q5BJE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC178Q5BJE1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC178Q5BJE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC178Q5BJE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC178Q5BJE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC178Q5BJE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms