Protein–RNA interactions for Protein: Q504T8

MIDN, Midnolin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIDNQ504T8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms