Protein–RNA interactions for Protein: Q504T8

MIDN, Midnolin, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIDNQ504T8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIDNQ504T8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIDNQ504T8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIDNQ504T8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIDNQ504T8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIDNQ504T8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MIDNQ504T8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIDNQ504T8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIDNQ504T8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MIDNQ504T8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms