Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TPRNQ4KMQ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TPRNQ4KMQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TPRNQ4KMQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TPRNQ4KMQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
TPRNQ4KMQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TPRNQ4KMQ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TPRNQ4KMQ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TPRNQ4KMQ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TPRNQ4KMQ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TPRNQ4KMQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TPRNQ4KMQ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms