Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
KRTAP21-1Q3LI58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms