Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRK1Q38SD2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRK1Q38SD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRK1Q38SD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRK1Q38SD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRK1Q38SD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRK1Q38SD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRK1Q38SD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRK1Q38SD2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRK1Q38SD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRK1Q38SD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRK1Q38SD2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRK1Q38SD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRK1Q38SD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRK1Q38SD2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRK1Q38SD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRK1Q38SD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms