Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR1Q2NL82 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR1Q2NL82 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSR1Q2NL82 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR1Q2NL82 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR1Q2NL82 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR1Q2NL82 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR1Q2NL82 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR1Q2NL82 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR1Q2NL82 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSR1Q2NL82 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TSR1Q2NL82 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TSR1Q2NL82 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TSR1Q2NL82 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSR1Q2NL82 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR1Q2NL82 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR1Q2NL82 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR1Q2NL82 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR1Q2NL82 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSR1Q2NL82 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSR1Q2NL82 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR1Q2NL82 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR1Q2NL82 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR1Q2NL82 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TSR1Q2NL82 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TSR1Q2NL82 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TSR1Q2NL82 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TSR1Q2NL82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSR1Q2NL82 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSR1Q2NL82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSR1Q2NL82 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms