Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ODF4Q2M2E3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ODF4Q2M2E3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF4Q2M2E3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ODF4Q2M2E3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ODF4Q2M2E3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ODF4Q2M2E3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ODF4Q2M2E3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF4Q2M2E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ODF4Q2M2E3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ODF4Q2M2E3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ODF4Q2M2E3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ODF4Q2M2E3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ODF4Q2M2E3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF4Q2M2E3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ODF4Q2M2E3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODF4Q2M2E3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ODF4Q2M2E3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ODF4Q2M2E3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms