Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RSPO4Q2I0M5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPO4Q2I0M5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPO4Q2I0M5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RSPO4Q2I0M5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPO4Q2I0M5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPO4Q2I0M5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RSPO4Q2I0M5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPO4Q2I0M5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPO4Q2I0M5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPO4Q2I0M5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPO4Q2I0M5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RSPO4Q2I0M5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RSPO4Q2I0M5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RSPO4Q2I0M5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RSPO4Q2I0M5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms