Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC5A12Q1EHB4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC5A12Q1EHB4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC5A12Q1EHB4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC5A12Q1EHB4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC5A12Q1EHB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC5A12Q1EHB4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC5A12Q1EHB4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC5A12Q1EHB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A12Q1EHB4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A12Q1EHB4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A12Q1EHB4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A12Q1EHB4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A12Q1EHB4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A12Q1EHB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A12Q1EHB4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC5A12Q1EHB4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC5A12Q1EHB4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A12Q1EHB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A12Q1EHB4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC5A12Q1EHB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms