Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPN21Q16825 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPN21Q16825 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPN21Q16825 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPN21Q16825 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPN21Q16825 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPN21Q16825 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPN21Q16825 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPN21Q16825 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPN21Q16825 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPN21Q16825 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPN21Q16825 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPN21Q16825 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPN21Q16825 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPN21Q16825 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPN21Q16825 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPN21Q16825 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPN21Q16825 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
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