Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDUFA9Q16795 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDUFA9Q16795 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDUFA9Q16795 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDUFA9Q16795 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDUFA9Q16795 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDUFA9Q16795 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDUFA9Q16795 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDUFA9Q16795 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDUFA9Q16795 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDUFA9Q16795 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFA9Q16795 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDUFA9Q16795 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NDUFA9Q16795 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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