Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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