Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLPPQ16740 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLPPQ16740 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLPPQ16740 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLPPQ16740 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLPPQ16740 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLPPQ16740 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLPPQ16740 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLPPQ16740 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLPPQ16740 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLPPQ16740 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLPPQ16740 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms