Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNCBQ16143 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNCBQ16143 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNCBQ16143 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNCBQ16143 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNCBQ16143 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNCBQ16143 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNCBQ16143 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNCBQ16143 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNCBQ16143 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNCBQ16143 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNCBQ16143 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNCBQ16143 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNCBQ16143 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms