Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPTX1Q15818 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPTX1Q15818 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPTX1Q15818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPTX1Q15818 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPTX1Q15818 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPTX1Q15818 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPTX1Q15818 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPTX1Q15818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPTX1Q15818 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPTX1Q15818 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPTX1Q15818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms