Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC1Q15751 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC1Q15751 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERC1Q15751 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HERC1Q15751 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERC1Q15751 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERC1Q15751 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERC1Q15751 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERC1Q15751 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms