Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3R2Q15599 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A3R2Q15599 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A3R2Q15599 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A3R2Q15599 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A3R2Q15599 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3R2Q15599 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3R2Q15599 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3R2Q15599 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3R2Q15599 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms