Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SS18Q15532 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SS18Q15532 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SS18Q15532 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SS18Q15532 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SS18Q15532 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SS18Q15532 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SS18Q15532 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SS18Q15532 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SS18Q15532 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SS18Q15532 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SS18Q15532 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SS18Q15532 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SS18Q15532 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SS18Q15532 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SS18Q15532 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SS18Q15532 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SS18Q15532 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SS18Q15532 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SS18Q15532 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SS18Q15532 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SS18Q15532 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SS18Q15532 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SS18Q15532 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SS18Q15532 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SS18Q15532 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SS18Q15532 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SS18Q15532 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SS18Q15532 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SS18Q15532 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SS18Q15532 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SS18Q15532 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SS18Q15532 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SS18Q15532 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SS18Q15532 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SS18Q15532 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SS18Q15532 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SS18Q15532 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SS18Q15532 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SS18Q15532 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SS18Q15532 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SS18Q15532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SS18Q15532 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SS18Q15532 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SS18Q15532 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SS18Q15532 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SS18Q15532 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SS18Q15532 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SS18Q15532 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SS18Q15532 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SS18Q15532 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SS18Q15532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SS18Q15532 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SS18Q15532 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SS18Q15532 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SS18Q15532 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SS18Q15532 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SS18Q15532 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SS18Q15532 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SS18Q15532 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SS18Q15532 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SS18Q15532 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SS18Q15532 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SS18Q15532 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SS18Q15532 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SS18Q15532 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SS18Q15532 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SS18Q15532 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SS18Q15532 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SS18Q15532 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SS18Q15532 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SS18Q15532 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SS18Q15532 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SS18Q15532 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SS18Q15532 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SS18Q15532 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SS18Q15532 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SS18Q15532 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SS18Q15532 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SS18Q15532 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SS18Q15532 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SS18Q15532 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SS18Q15532 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SS18Q15532 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SS18Q15532 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SS18Q15532 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SS18Q15532 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SS18Q15532 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SS18Q15532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SS18Q15532 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SS18Q15532 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SS18Q15532 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18Q15532 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18Q15532 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18Q15532 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18Q15532 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SS18Q15532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SS18Q15532 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SS18Q15532 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.4 ms