Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAM2Q15035 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAM2Q15035 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAM2Q15035 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAM2Q15035 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAM2Q15035 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAM2Q15035 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAM2Q15035 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAM2Q15035 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAM2Q15035 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAM2Q15035 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAM2Q15035 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAM2Q15035 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAM2Q15035 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAM2Q15035 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAM2Q15035 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAM2Q15035 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAM2Q15035 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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