Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPARCL1Q14515 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPARCL1Q14515 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPARCL1Q14515 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPARCL1Q14515 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPARCL1Q14515 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPARCL1Q14515 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPARCL1Q14515 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPARCL1Q14515 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPARCL1Q14515 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPARCL1Q14515 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPARCL1Q14515 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms