Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTMR3Q13615 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTMR3Q13615 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTMR3Q13615 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTMR3Q13615 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTMR3Q13615 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTMR3Q13615 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MTMR3Q13615 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTMR3Q13615 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTMR3Q13615 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTMR3Q13615 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR3Q13615 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
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