Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RIPK1Q13546 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RIPK1Q13546 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RIPK1Q13546 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK1Q13546 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK1Q13546 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK1Q13546 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIPK1Q13546 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RIPK1Q13546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RIPK1Q13546 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIPK1Q13546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIPK1Q13546 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIPK1Q13546 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIPK1Q13546 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK1Q13546 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK1Q13546 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIPK1Q13546 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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